Археологическо откритие в Ахтопол преобръща представите за историята в региона. Едно от най-значимите духовни средища по Южното Черноморие, ахтополският манастир "Свети Йоан Предтеча" – известен сред местните жители като "Свети Яни" – е обект на усилени археологически проучвания, които хвърлят нова светлина върху миналото на района. Националният исторически музей и Община Царево, с активното съдействие на кмета Марин Киров, са обединили усилията си за разкриване на тайните на този значим исторически обект.
През 2025 година, благодарение на партньорството между Националния исторически музей и Община Царево, продължават археологическите разкопки. Директорът на Националния исторически музей доц. д-р Бони Петрунова ръководи проучванията, а кметството на Ахтопол активно съдейства за успешното реализиране на дейностите.
Манастирът е разположен на едноименния нос, южно от пристанищния залив на град Ахтопол. Според наличните данни, в миналото тук е пребивавал Агатополският митрополит до 1829 г. В средата на XX век, на мястото на манастира е изградено поделение на Гранична полиция.
През 2019 г. Гранична полиция предоставя имота на Министерството на културата, а година по-късно Министерството го предава за управление на Националния исторически музей. Впоследствие НИМ разработва идеен проект за преустройство на полуострова в културен център, който ще обедини археология, история и съвременни културни прояви.
Предполага се, че великолепният ахтополски манастир "Свети Йоан Предтеча" е бил изграден някъде през XII–XIII век. В рамките на последните пет археологически сезона са разкрити основите на най-дългата църква, откривана досега по южното българско Черноморие. Това само по себе си свидетелства за значимата роля на средновековния Агатопол като един от петте известни епископски центъра по южното черноморско крайбрежие на днешна България.
На мястото на обекта са открити впечатляващите 257 археологически находки. Всяка година, тези находки се представят в Музея на котвата в хотел "Невен". Сред най-впечатляващите експонати са сребърни монети от Ахейското княжество, включително такива на Гийом II дьо Вилардуен, Изабел I дьо Вилардуен и Шарл II Анджуйски, златна монета на Сюлейман Великолепни, както и изящен кръст от яспис и две келтски бронзови фибули от римската епоха (III в.).
Това място представлява едно от най-впечатляващите археологически обекти по Южното Черноморие. Откритията тук променят представите ни за ролята и значението на средновековния Агатопол в историята на региона.
Проучванията на манастира "Свети Яни" са част от по-широката визия на Община Царево за опазване и популяризиране на културно-историческото наследство. С усилията на местната власт, Националния исторически музей и научния екип, Ахтопол постепенно възвръща своето духовно и историческо значение. Откритията са посрещнати с голям интерес от местната общност, която вижда в тях нова перспектива за развитие на региона. Туристите вече не са привлечени единствено от прекрасната природа и морето, но и от живия разказ за богатата история на древния Агатополис - един от най-значимите духовни и културни центрове на българското Черноморие.